根據《中共衡陽市委衡陽市人民政府關于印發〈衡陽市人民政府機構改革方案的實施意見〉的通知》（衡發〔2010〕3號）和《中共衡陽市委衡陽市人民政府關于衡陽市人民政府機構設置的通知》（衡委〔2010〕4號），設立衡陽市供銷合作總社，為市人民政府直屬正處級參公事業單位。文件規定了衡陽市供銷合作總社的主要職能：1、負責制定全市供銷合作社系統改革和發展規劃，組織指導全市系統具體實施。貫徹執行中共中央、國務院、省、市黨委政府和中華全國供銷合作總社等有關供銷社改革發展的路線、方針、政策和法規。認真履行對全市供銷社系統的指導、協調、監督、服務、教育培訓職能。2、負責建設全市農村現代商品流通體系。主要發展農業生產資料、農村日用消費品（含圖書、藥品）、農副產品現代購銷、再生資源（含報廢車輛）回收利用和煙花炮竹歸口經營五大經營網絡。3、負責建立新型的完整的為農服務體系。采取創辦、領辦、聯辦等形式發展農民專業合作社，創辦農產品基地，組建有關行業協會，負責在全市農村社區建立主體多元、功能完備、便民實用的綜合服務中心。4、指導全市供銷合作社系統做大做強社有企業，培育參股控股各類龍頭企業，推進社有企業健全現代企業制度，推動社有企業參與農業產業化、標準化示范、農業技術研發推廣等項目，積極探索發展適合當地農村特點的金融產品和服務方式。5、承擔化肥、農藥、棉花、食用油等重要物資的國家和地方政府儲備及救災物資儲備等任務。會同有關部門參與全市農村商品流通及市場體系建設的規劃編制及修訂；參與有關農業生產資料和煙花爆竹行業的市場管理；參與管理指導農民專業合作社、行業協會、農產品經紀人隊伍的建設；參與管理指導全市再生資源回收利用市場體系建設。6、指導、監督和管理好全市供銷合作社系統的資產，按規定管理好市本級的社有資產，確保社有資產保值增值，依法依規依政策維護供銷社的合法權益。7、指導全市供銷社系統的科技開發和有關科技成果的轉化及推廣工作，推進科技興社。8、指導供銷社系統通過各種措施加強人才隊伍建設，實施人才興社戰略，優化干部職工知識和年齡結構。培育造就甘于奉獻，勇于開拓、善于創新的干部職工隊伍。
2015年
之后衡編辦函〔2015〕76號文件對衡陽市供銷合作總社內設機構和職數進行過小幅調整。調整后內設機構為11個：辦公室、組織人事科、財務科、合作指導科、生產科技科、社有資產管理科、法律顧問室、審計科、安全信訪科、離退休人員管理服務科、監事會辦公室。新時代、新供銷、新使命，內設機構、人員編制已不符合時代變化，亟需修訂。2020年12月18日，經十一屆市委第165次常委會會議（2020年第40次市委常委會會議）審議，原則同意市供銷合作總社修訂“三定”方案。后經市委機構編制委員會辦公室2021年2月9日主任辦公會研究，同意衡陽市供銷合作總社內設機構作如下調整：一、將法律顧問室更名為宣傳法規科，其主要工作任務是：負責宣傳、貫徹黨和國家有關"三農"工作及供銷合作社改革發展的方針政策和法律法規，牽頭擬訂市供銷合作改革發展意見、辦法并監督實施，研究提出市供銷合作體制創新的政策建議；承擔市社機關規范性文件的合法性審核和行政復議、行政應訴等工作；負責市社法制建設、普法工作和法律服務工作；負責市社的宣傳教育、意識形態和精神文明建設工作，指導縣市及南岳區供銷社開展法制宣傳和法律援助工作；負責市社社務信息工作的規劃、管理和新聞發布，指導系統社務信息工作；負責市社黨委理論學習中心組理論學習的相關工作。二、將合作指導科改為合作經濟科，其主要工作任務是：負責擬訂全市供銷合作經濟的發展規劃，指導基層供銷合作社發展；負責發展和規范農民專業合作社、綜合服務社和消費、金融、土地托管等新型合作經濟組織以及行業協會等社.會團體，維護供銷合作社、農民合作經濟組織及其社員（會員）的合法權益；指導市供銷合作系統合作經濟組織的合作與聯合，組織開展對外交流、農產品展示展銷、品牌營銷、農村金融合作、電子商務等工作；指導縣市及南岳區供銷合作社推廣使用統一和規范的中國供銷合作社標識；承擔市農村合作經濟組織聯合會的日常工作。
三、將生產科技科改為綜合服務科，其主要工作任務是：負責組織全市供銷合作系統參與鄉村振興戰略，推進新農村現代流通網絡建設，開展農業生產資料供應、農村日用消費品、冷鏈物流建設、農業社會化服務、再生資源回收利用、農副產品加工及購銷等業務；根據政府授權，對重要農業生產資料、棉花及其他商品的經營、儲備進行組織、協調和管理，承擔政府向社會力量購買的公共服務。
四、將監事會辦公室與審計科整合為監督審計科（監事會辦公室），其主要工作任務是：負責監事會日常工作，監督理事會對社員代表大會決議和有關法律、法規和政策的執行情況；監督檢查社有資產的保值增值，維護供銷合作社的合法權益，依法對本單位及所屬企事業單位進行內部審計；指導全市供銷合作系統的內部審計工作；會同有關部門對全市供銷合作系統違反財經紀律、經濟違法問題開展專項審計，并提出相關處理意見；負責指導市供銷合作社派駐公司監事的工作。
五、設立改革發展科，其主要工作任務是：負責宣傳貫徹上級有關農業農村經濟工作的方針政策，編制全市系統改革發展、經濟運行規劃，并組織實施；牽頭負責全市供銷合作系統業績考核、統計工作；負責指導全市供銷合作系統新產業、新業態發展，打造城鄉社區綜合服務平臺，指導全市系統惠農服務中心的改革發展；指導全市系統建立健全"三會"制度，承擔全市供銷合作社代表大會代表聯絡工作。
調整后，內設機構為：辦公室、組織人事科、宣傳法規科、財務科、改革發展科、合作經濟科、綜合服務科、社有資產管理科、安全信訪科、監督審計科、離退休人員管理服務科。
